进行万方检测前后重复率对比的方法有很多种，其中一种常用的方法是先将原始论文上传至万方数据库进行查重，得到查重报告后，再对照着原始论文逐一核对。在核对过程中，需要注意标记出重复部分，并进行比对分析。另外，还可以利用专业的查重软件进行对比，比如Turnitin等，这样可以更加直观地看到重复率的变化。在对比的过程中，需要注意保持论文的原汁原味，避免误判。

除了以上方法外，还可以采用分段对比的方式进行万方检测前后重复率对比。具体做法是将原始论文和万方检测报告分段进行对比，逐段核对是否存在重复。这种方法相对更加细致，可以更容易地发现重复率的变化。同时，在对比过程中，也可以结合自身的研究成果和思考，对于论文的修改和优化提供更多的参考价值。